About this Course
최근 조회 2,186

100% 온라인

지금 바로 시작해 나만의 일정에 따라 학습을 진행하세요.

유동적 마감일

일정에 따라 마감일을 재설정합니다.

중급 단계

완료하는 데 약 14시간 필요

권장: 4-5 hours/week...

영어

자막: 영어

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강의 계획 - 이 강좌에서 배울 내용

1
완료하는 데 2시간 필요

The Library of Integrated Network-based Cellular Signatures (LINCS) Program Overview

This module provides an overview of the concept behind the LINCS program; and tutorials on how to get started with using the LINCS L1000 dataset.

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8 videos (Total 78 min), 2 readings
8개의 동영상
The Connectivity Map8m
Geometrical View of the Connectivity Map Concept3m
LINCS Data and Signature Generation Centers12m
BD2K-LINCS Data Coordination and Integration Center4m
Induced Pluripotent Stem Cells (iPSCs)4m
Introduction to LINCS L1000 Data22m
L1000 Characteristic Direction Signature Search Engine (L1000CDS2) Demo13m
2개의 읽기 자료
Syllabus10m
Grading and Logistics10m
완료하는 데 26분 필요

Metadata and Ontologies

This module includes a broad high level description of the concepts behind metadata and ontologies and how these are applied to LINCS datasets.

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2 videos (Total 26 min)
2개의 동영상
Introduction to Metadata and Ontologies | Part 220m
완료하는 데 24분 필요

Serving Data with APIs

In this module we explain the concept of accessing data through an application programming interface (API).

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2 videos (Total 19 min)
2개의 동영상
Accessing and Serving Data through RESTful APIs | Part 210m
2
완료하는 데 19분 필요

Bioinformatics Pipelines

This module describes the important concept of a Bioinformatics pipeline.

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1 video (Total 14 min)
완료하는 데 1시간 필요

The Harmonizome

This module describes a project that integrates many resources that contain knowledge about genes and proteins. The project is called the Harmonizome, and it is implemented as a web-server application available at: http://amp.pharm.mssm.edu/Harmonizome/

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4 videos (Total 37 min)
4개의 동영상
Processing Datasets | Part 18m
Processing Datasets | Part 29m
Processing Datasets | Part 37m
3
완료하는 데 24분 필요

Data Normalization

This module describes the mathematical concepts behind data normalization.

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2 videos (Total 19 min)
2개의 동영상
Data Normalization | Part 213m
완료하는 데 1시간 필요

Data Clustering

This module describes the mathematical concepts behind data clustering, or in other words unsupervised learning - the identification of patterns within data without considering the labels associated with the data.

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3 videos (Total 33 min)
3개의 동영상
Data Clustering | Part 2 | Distance Functions 12m
Data Clustering | Part 3 | Algorithms and Evaluation15m
완료하는 데 2시간 필요

Midterm Exam

The Midterm Exam consists of 45 multiple choice questions which covers modules 1-7. Some of the questions may require you to perform some analysis with the methods you learned throughout the course on new datasets.

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1 quiz
1개 연습문제
Midterm Exam1시 30분
4
완료하는 데 29분 필요

Enrichment Analysis

This module introduces the important concept of performing gene set enrichment analyses. Enrichment analysis is the process of querying gene sets from genomics and proteomics studies against annotated gene sets collected from prior biological knowledge.

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3 videos (Total 29 min)
3개의 동영상
Enrichment Analysis | Part 27m
Enrichr Demo9m
완료하는 데 1시간 필요

Machine Learning

This module describes the mathematical concepts of supervised machine learning, the process of making predictions from examples that associate observations/features/attribute with one or more properties that we wish to learn/predict.

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3 videos (Total 27 min)
3개의 동영상
Introduction to Machine Learning | Part 2 8m
Introduction to Machine Learning | Part 39m
4.9
4개의 리뷰Chevron Right

Big Data Science with the BD2K-LINCS Data Coordination and Integration Center의 최상위 리뷰

대학: MSJan 21st 2017

A very practical courses. Very good introduction to Big Data sources and Computational Analysis tool.

대학: HHSep 19th 2018

excellent oppurtunity for the data science learners

강사

Avatar

Avi Ma’ayan, PhD

Director, Mount Sinai Center for Bioinformatics
Professor, Department of Pharmacological Sciences

마운트사이나이 아이칸 의과대학 정보

The Icahn School of Medicine at Mount Sinai, in New York City is a leader in medical and scientific training and education, biomedical research and patient care....

자주 묻는 질문

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