In this course, you will learn how to use the BaseSpace cloud platform developed by Illumina (our industry partner) to apply several standard bioinformatics software approaches to real biological data.
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About this Course
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100% 온라인
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다음 전문 분야의 7개 강좌 중 7번째 강좌:
유동적 마감일
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초급 단계
완료하는 데 약 15시간 필요
권장: 3 weeks of study, 3-4 hours/week
영어
자막: 영어
강의 계획 - 이 강좌에서 배울 내용
완료하는 데 5시간 필요
Week 1: Identifying the Culprit in a Food Poisoning Outbreak
This week, we will apply genome sequencing algorithms to identify the bacterium causing a deadly food poisoning outbreak.
완료하는 데 5시간 필요
5 readings
5개의 읽기 자료
Note on Class Structure10m
Welcome to Class!10m
Special Thanks2m
Introduction15m
Databases and Tools5m
완료하는 데 4시간 필요
Week 2: Comparing Gene Expression in Tissue Samples with RNA-Seq
In this week's Application Challenge, we will learn how RNA-Sequencing can be applied to perform tissue-level gene expression analysis. In particular, which is more similar on a gene expression level: different tissues from the same organism, or analogous tissues from related species? This question was the subject of recent debate and a Twitter controversy -- read more to find out!
완료하는 데 4시간 필요
2 readings
2개의 읽기 자료
Introduction15m
Databases and Tools5m
완료하는 데 5시간 필요
Week 3: Weighing the Pros and Cons of Whole Genome and Whole Exome Sequencing on a Human Sample
Comparing the differences between sequencing an entire human genome and sequencing only the exome, or the DNA that is eventually translated into protein. Can we obtain a complete picture of someone's genetic disease predispositions from only the exome, or is there information lurking in introns that can provide doctors with vital information? How do we weigh the trade-offs when considering genome and exome sequencing?
완료하는 데 5시간 필요
4 readings
4개의 읽기 자료
Introduction15m
Databases and Tools10m
Walkthroughs15m
Reading: Part 3 FAQs
캘리포니아 샌디에고 대학교 정보
UC San Diego is an academic powerhouse and economic engine, recognized as one of the top 10 public universities by U.S. News and World Report. Innovation is central to who we are and what we do. Here, students learn that knowledge isn't just acquired in the classroom—life is their laboratory.
생물 정보학 전문 분야 정보
Join Us in a Top 50 MOOC of All Time!
How do we sequence and compare genomes? How do we identify the genetic basis for disease? How do we construct an evolutionary Tree of Life for all species on Earth?
When you complete this Specialization, you will learn how to answer many questions in modern biology that have become inseparable from the computational approaches used to solve them. You will also obtain a toolkit of existing software resources built on these computational approaches and that are used by thousands of biologists every day in one of the fastest growing fields in science.
Although this Specialization centers on computational topics, you do not need to know how to program in order to complete it. If you are interested in programming, we feature an "Honors Track" (called "hacker track" in previous runs of the course). The Honors Track allows you to implement the bioinformatics algorithms that you will encounter along the way in dozens of automatically graded coding challenges. By completing the Honors Track, you will be a bioinformatics software professional!
Learn more about the Bioinformatics Specialization (including why we are wearing these crazy outfits) by watching our introductory video.
You can purchase the Specialization's print companion, Bioinformatics Algorithms: An Active Learning Approach, from the textbook website.
Our first course, "Finding Hidden Messages in DNA", was named a top-50 MOOC of all time by Class Central!
자주 묻는 질문
강의 및 과제를 언제 이용할 수 있게 되나요?
강좌에 등록하면 바로 모든 비디오, 테스트 및 프로그래밍 과제(해당하는 경우)에 접근할 수 있습니다. 상호 첨삭 과제는 이 세션이 시작된 경우에만 제출하고 검토할 수 있습니다. 강좌를 구매하지 않고 살펴보기만 하면 특정 과제에 접근하지 못할 수 있습니다.
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