About this Course
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다음 전문 분야의 7개 강좌 중 2번째 강좌:

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완료하는 데 약 17시간 필요

영어

자막: 영어, 포르투갈어 (브라질), 중국어 (간체자)
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Course을(를) 수강하는 학습자
  • Biostatisticians
  • Biologists
  • Scientists
  • Researchers
  • Data Scientists

귀하가 습득할 기술

AlgorithmsPython ProgrammingWhole Genome SequencingDynamic Programming
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강의 계획 - 이 강좌에서 배울 내용

1
완료하는 데 4시간 필요

Week 1: Introduction to Genome Sequencing

8개 동영상 (총 36분), 2 readings, 3 quizzes
8개의 동영상
FIELD TRIP!4m
What Is Genome Sequencing?6m
Exploding Newspapers4m
The String Reconstruction Problem3m
String Reconstruction as a Hamiltonian Path Problem3m
String Reconstruction as an Eulerian Path Problem5m
Similar Problems with Different Fates 3m
2개의 읽기 자료
Course Details10m
Week 1 FAQs (Optional)
1개 연습문제
Week 1 Quiz15m
2
완료하는 데 3시간 필요

Week 2: Applying Euler's Theorem to Assemble Genomes

5개 동영상 (총 28분), 1 reading, 3 quizzes
5개의 동영상
Euler's Theorem 6m
Assembling Read-Pairs 8m
De Bruijn Graphs Face Harsh Realities of Assembly 4m
Returning to Konigsberg 1m
1개의 읽기 자료
Week 2 FAQs (Optional)
1개 연습문제
Week 2 Quiz15m
3
완료하는 데 4시간 필요

Week 3: Sequencing Antibiotics

5개 동영상 (총 27분), 1 reading, 3 quizzes
5개의 동영상
How Do Bacteria Make Antibiotics? 8m
Sequencing Antibiotics by Shattering Them into Pieces 4m
A Brute Force Algorithm for Cyclopeptide Sequencing 3m
Cyclopeptide Sequencing with Branch and Bound 6m
1개의 읽기 자료
Week 3 FAQs (Optional)
1개 연습문제
Week 3 Quiz15m
4
완료하는 데 3시간 필요

Week 4: From Ideal to Real Spectra for Antibiotics Sequencing

4개 동영상 (총 18분), 1 reading, 3 quizzes
4개의 동영상
From 20 to More than 100 Amino Acids 2m
The Spectral Convolution Saves the Day 6m
The Truth About Spectra 2m
1개의 읽기 자료
Week 4 FAQs (Optional)
1개 연습문제
Week 4 Quiz15m
4.7
44개의 리뷰Chevron Right

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Genome Sequencing (Bioinformatics II)의 최상위 리뷰

대학: SVJan 10th 2017

Great course to explore a bit of Bioinformatics for those with no background in Bioinformatics. I love the way the content has been provided, its interactivity increases the interest in the course.

대학: MPDec 8th 2017

I like the real-world tasks, especially the assembly on the final exam. Some of the programming tasks, such as the antibiotic noisy spectrum assembly, are challenging (which is good).

강사

Avatar

Pavel Pevzner

Professor
Department of Computer Science and Engineering
Avatar

Phillip Compeau

Visiting Researcher
Department of Computer Science & Engineering

캘리포니아 샌디에고 대학교 정보

UC San Diego is an academic powerhouse and economic engine, recognized as one of the top 10 public universities by U.S. News and World Report. Innovation is central to who we are and what we do. Here, students learn that knowledge isn't just acquired in the classroom—life is their laboratory....

생물 정보학 전문 분야 정보

Join Us in a Top 50 MOOC of All Time! How do we sequence and compare genomes? How do we identify the genetic basis for disease? How do we construct an evolutionary Tree of Life for all species on Earth? When you complete this Specialization, you will learn how to answer many questions in modern biology that have become inseparable from the computational approaches used to solve them. You will also obtain a toolkit of existing software resources built on these computational approaches and that are used by thousands of biologists every day in one of the fastest growing fields in science. Although this Specialization centers on computational topics, you do not need to know how to program in order to complete it. If you are interested in programming, we feature an "Honors Track" (called "hacker track" in previous runs of the course). The Honors Track allows you to implement the bioinformatics algorithms that you will encounter along the way in dozens of automatically graded coding challenges. By completing the Honors Track, you will be a bioinformatics software professional! Learn more about the Bioinformatics Specialization (including why we are wearing these crazy outfits) by watching our introductory video. You can purchase the Specialization's print companion, Bioinformatics Algorithms: An Active Learning Approach, from the textbook website. Our first course, "Finding Hidden Messages in DNA", was named a top-50 MOOC of all time by Class Central!...
생물 정보학

자주 묻는 질문

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