How do we infer which genes orchestrate various processes in the cell? How did humans migrate out of Africa and spread around the world? In this class, we will see that these two seemingly different questions can be addressed using similar algorithmic and machine learning techniques arising from the general problem of dividing data points into distinct clusters.
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생물 정보학 특화 과정캘리포니아 샌디에고 대학교이 강좌에 대하여
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학습자 경력 결과
33%
가 이 강좌를 통해 확실한 경력상 이점을 얻음
공유 가능한 수료증
완료 시 수료증 획득
100% 온라인
지금 바로 시작해 나만의 일정에 따라 학습을 진행하세요.
다음 특화 과정의 7개 강좌 중 5번째 강좌:
유동적 마감일
일정에 따라 마감일을 재설정합니다.
초급 단계
완료하는 데 약 9시간 필요
영어
자막: 영어
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캘리포니아 샌디에고 대학교
UC San Diego is an academic powerhouse and economic engine, recognized as one of the top 10 public universities by U.S. News and World Report. Innovation is central to who we are and what we do. Here, students learn that knowledge isn't just acquired in the classroom—life is their laboratory.
강의 계획 - 이 강좌에서 배울 내용
완료하는 데 5시간 필요
Week 1: Introduction to Clustering Algorithms
<p>Welcome to class!</p><p>At the beginning of the class, we will see how algorithms for <strong>clustering </strong>a set of data points will help us determine how yeast became such good wine-makers. At the bottom of this email is the Bioinformatics Cartoon for this chapter, courtesy of <a href="http://bearandfox.com" target="_blank" title="Link: http://bearandfox.com">Randall Christopher</a> and serving as a chapter header in the Specialization's bestselling <a href="http://bioinformaticsalgorithms.com" target="_blank">print companion</a>. How did the monkey lose a wine-drinking contest to a tiny mammal? Why have Pavel and Phillip become cavemen? And will flipping a coin help them escape their eternal boredom until they can return to the present? Start learning to find out!</p><p><img width="550" alt="" src="http://bioinformaticsalgorithms.com/images/cover/clustering_cropped.jpg" title="Image: http://bioinformaticsalgorithms.com/images/cover/clustering_cropped.jpg"></p>
완료하는 데 5시간 필요
5개 동영상 (총 33분), 2 개의 읽기 자료, 3 개의 테스트
5개의 동영상
Which Yeast Genes are Responsible for Wine Making? 6m
Gene Expression Matrices 6m
Clustering as an Optimization Problem 10m
The Lloyd Algorithm for k-Means Clustering 5m
2개의 읽기 자료
Course Details10m
Week 1 FAQs (Optional)
1개 연습문제
Week 1 Quiz20m
완료하는 데 4시간 필요
Week 2: Advanced Clustering Techniques
<p>Welcome to week 2 of class!</p>
완료하는 데 4시간 필요
5개 동영상 (총 35분), 1 개의 읽기 자료, 3 개의 테스트
5개의 동영상
From Coin Flipping to k-Means Clustering 4m
Expectation Maximization 7m
Soft k-Means Clustering 3m
Hierarchical Clustering 7m
1개의 읽기 자료
Week 2 FAQs (Optional)
1개 연습문제
Week 2 Quiz15m
완료하는 데 1시간 필요
Week 3: Introductory Algorithms in Population Genetics
완료하는 데 1시간 필요
2 개의 읽기 자료
2개의 읽기 자료
Statement on This Week's Material10m
How Have Humans Populated the Earth?10m
1개 연습문제
Week 3 Quiz10m
검토
GENOMIC DATA SCIENCE AND CLUSTERING (BIOINFORMATICS V)의 최상위 리뷰
DD 제공2019년 10월 23일
Truly awesome. What I liked best was that this course didn't have a peer reviewed final challenge, so I didn't have to wait months until my work was graded :)
QW 제공2017년 5월 21일
The first two week was very good, but for week 3 I don't see the content has any connection with Genomic Data Science.
MK 제공2020년 5월 14일
Very interesting course! So inspiring :) Recommend for everyone who interested in bioinformatic
JM 제공2020년 3월 21일
Really enjoyed the clustering chapters and the practical exercises with the yeast dataset
생물 정보학 특화 과정 정보
Join Us in a Top 50 MOOC of All Time!
How do we sequence and compare genomes? How do we identify the genetic basis for disease? How do we construct an evolutionary Tree of Life for all species on Earth?
When you complete this Specialization, you will learn how to answer many questions in modern biology that have become inseparable from the computational approaches used to solve them. You will also obtain a toolkit of existing software resources built on these computational approaches and that are used by thousands of biologists every day in one of the fastest growing fields in science.
Although this Specialization centers on computational topics, you do not need to know how to program in order to complete it. If you are interested in programming, we feature an "Honors Track" (called "hacker track" in previous runs of the course). The Honors Track allows you to implement the bioinformatics algorithms that you will encounter along the way in dozens of automatically graded coding challenges. By completing the Honors Track, you will be a bioinformatics software professional!
Learn more about the Bioinformatics Specialization (including why we are wearing these crazy outfits) by watching our introductory video.
You can purchase the Specialization's print companion, Bioinformatics Algorithms: An Active Learning Approach, from the textbook website.
Our first course, "Finding Hidden Messages in DNA", was named a top-50 MOOC of all time by Class Central!
자주 묻는 질문
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