About this Course
19,081

다음의 5/8개 강좌

100% 온라인

지금 바로 시작해 나만의 일정에 따라 학습을 진행하세요.

탄력적인 마감일

일정에 따라 마감일을 재설정합니다.

완료하는 데 약 26시간 필요

영어

자막: 영어

귀하가 습득할 기술

BioinformaticsSamtoolsUnixCommand-Line Interface

다음의 5/8개 강좌

100% 온라인

지금 바로 시작해 나만의 일정에 따라 학습을 진행하세요.

탄력적인 마감일

일정에 따라 마감일을 재설정합니다.

완료하는 데 약 26시간 필요

영어

자막: 영어

강의 계획 - 이 강좌에서 배울 내용

1
완료하는 데 3시간 필요

Basic Unix Commands

In this module, you will be introduced to command Line Tools for Genomic Data Science...
12 videos (Total 105 min), 5 readings, 2 quizzes
12개의 동영상
Basic Unix Commands 2: Files, Directories, Paths7m
Basic Unix Commands 3: File Naming4m
Basic Unix Commands 4: Content Creation9m
Basic Unix Commands 5: Accessing Content I6m
Basic Unix Commands 6: Accessing Content II4m
Basic Unix Commands 7: Redirecting Content6m
Basic Unix Commands 8: Querying Content15m
Basic Unix Commands 9: Comparing Content11m
Basic Unix Commands 10: Archiving Content13m
Basic Unix Commands 11: Practical Exercises I13m
Basic Unix Commands 12: Practical Exercises II9m
5개의 읽기 자료
Welcome Message10m
Syllabus10m
VMBox Download & Instructions10m
Pre-Course Survey10m
Module 1 Exam Instructions **IMPORTANT**10m
2개 연습문제
Module 1 Quiz20m
Module 1 Exam34m
2
완료하는 데 3시간 필요

Week Two

In this module, we'll be taking a look at Sequences and Genomic Features in a sequence of 10 presentations. ...
11 videos (Total 127 min), 1 reading, 2 quizzes
11개의 동영상
Sequences and Genomic Features 2: Sequence Representation and Generation11m
Sequences and Genomic Features 3: Annotation14m
Sequences and Genomic Features 4.1: Alignment I13m
Sequences and Genomic Features 4.2: Alignment II9m
Sequences and Genomic Features 5: Recreating Sequences & Features12m
Sequences and Genomic Features 6: Genomic Feature Retrieval5m
Sequences and Genomic Features 7: SAMtools I11m
Sequences and Genomic Features 8: SAMtools II9m
Sequences and Genomic Features 9: BEDtools I15m
Sequences and Genomic Features 10: BEDtools II15m
1개의 읽기 자료
Module 2 Exam Instructions **IMPORTANT**10m
2개 연습문제
Module 2 Quiz20m
Module 2 Exam40m
3
완료하는 데 2시간 필요

Week Three

In this module, we'll be going over Alignment and Sequence Variation in another sequence of 8 presentations....
8 videos (Total 55 min), 1 reading, 2 quizzes
8개의 동영상
Alignment & Sequence Variation 2: Alignment & Variant Detection Tools5m
Alignment & Sequence Variation 3: VCF11m
Alignment & Sequence Variation 4: Bowtie9m
Alignment & Sequence Variation 5: BWA 4m
Alignment & Sequence Variation 6: SAMtools (mpileup)6m
Alignment & Sequence Variation 7: BCFtools8m
Alignment & Sequence Variation 8: Variant Calling5m
1개의 읽기 자료
Module 3 Exam Instructions **IMPORTANT**10m
2개 연습문제
Module 3 Quiz20m
Module 3 Exam48m
4
완료하는 데 3시간 필요

Week Four

In this module, we'll be going over Tools for Transcriptomics in a sequence of 6 presentations....
8 videos (Total 75 min), 2 readings, 2 quizzes
8개의 동영상
Tools for Transcriptomics 2: RNA-seq7m
Tools for Transcriptomics 3.1: Tophat I9m
Tools for Transcriptomics 3.2: Tophat II 8m
Tools for Transcriptomics 4: Cufflinks10m
Tools for Transcriptomics 5: Cuffdiff16m
Tools for Transcriptomics 6.1: Integrated Genomics Viewer I8m
Tools for Transcriptomics 6.2: Integrated Genomics Viewer II 6m
2개의 읽기 자료
Module 4 Exam Instructions **IMPORTANT**10m
Post-Course Survey10m
2개 연습문제
Module 4 Quiz20m
Module 4 Exam10m
4.2
81개의 리뷰Chevron Right

50%

이 강좌를 수료한 후 새로운 경력 시작하기

43%

이 강좌를 통해 확실한 경력상 이점 얻기

20%

급여 인상 또는 승진하기

최상위 리뷰

대학: JJJun 23rd 2018

Thank you very much Dr./Professor, Liliana Florea. I've learned a lot. It's a very good opportunity to improve my knowledge. This means a lot to me.

대학: GVMar 14th 2016

Very informative course. Because I am new to this, it was at times confusing. But overall, great teaching and great experience. Thank you.

강사

Avatar

Liliana Florea, PhD

Assistant Professor
McKusick-Nathans Institute of Genetic Medicine

존스홉킨스대학교 정보

The mission of The Johns Hopkins University is to educate its students and cultivate their capacity for life-long learning, to foster independent and original research, and to bring the benefits of discovery to the world....

Genomic Data Science 전문 분야 정보

This specialization covers the concepts and tools to understand, analyze, and interpret data from next generation sequencing experiments. It teaches the most common tools used in genomic data science including how to use the command line, Python, R, Bioconductor, and Galaxy. The sequence is a stand alone introduction to genomic data science or a perfect compliment to a primary degree or postdoc in biology, molecular biology, or genetics. To audit Genomic Data Science courses for free, visit https://www.coursera.org/jhu, click the course, click Enroll, and select Audit....
Genomic Data Science

자주 묻는 질문

  • 강좌에 등록하면 바로 모든 비디오, 테스트 및 프로그래밍 과제(해당하는 경우)에 접근할 수 있습니다. 상호 첨삭 과제는 이 세션이 시작된 경우에만 제출하고 검토할 수 있습니다. 강좌를 구매하지 않고 살펴보기만 하면 특정 과제에 접근하지 못할 수 있습니다.

  • 강좌를 등록하면 전문 분야의 모든 강좌에 접근할 수 있고 강좌를 완료하면 수료증을 취득할 수 있습니다. 전자 수료증이 성취도 페이지에 추가되며 해당 페이지에서 수료증을 인쇄하거나 LinkedIn 프로필에 수료증을 추가할 수 있습니다. 강좌 내용만 읽고 살펴보려면 해당 강좌를 무료로 청강할 수 있습니다.

궁금한 점이 더 있으신가요? 학습자 도움말 센터를 방문해 보세요.