Access Bioinformatics Databases with Biopython

제공자:
Coursera Project Network
학습자는 이 안내 프로젝트에서 다음을 수행하게 됩니다.

Sequence alignment using NCBI-BLAST

Fetch PUBMED & Nucleotide sequence using ENTREZ, PDB, EXPASY

Access KEGG pathways and genes

Clock1 hour
Intermediate중급
Cloud다운로드 필요 없음
Video분할 화면 동영상
Comment Dots영어
Laptop데스크톱 전용

In this 1-hour long project-based course, you will learn how to access, parse, and visualize data from various bioinformatics sequence and structural online databases such as ENTREZ, PDB, KEGG and NCBI using Biopython. You will also interact with various bioinformatics file formats such as FASTA, PDB, GENBANK and XML along with various parsers to read and modify these files using Biopython. Note: This course works best for learners who are based in the North America region. We’re currently working on providing the same experience in other regions.

개발할 기술

  • Bioinformatics
  • Python Programming
  • access biological database

단계별 학습

작업 영역이 있는 분할 화면으로 재생되는 동영상에서 강사는 다음을 단계별로 안내합니다.

  1. Sequence alignment using NCBI-BLAST

  2. Fetch PUBMED & Nucleotide sequence using ENTREZ

  3. Fetch proteins from PDB

  4. PROSITE & SCANPROSITE from EXPASY

  5. Access KEGG database

안내형 프로젝트 진행 방식

작업 영역은 브라우저에 바로 로드되는 클라우드 데스크톱으로, 다운로드할 필요가 없습니다.

분할 화면 동영상에서 강사가 프로젝트를 단계별로 안내해 줍니다.

자주 묻는 질문

자주 묻는 질문

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