이 강좌에 대하여

최근 조회 9,364
공유 가능한 수료증
완료 시 수료증 획득
100% 온라인
지금 바로 시작해 나만의 일정에 따라 학습을 진행하세요.
유동적 마감일
일정에 따라 마감일을 재설정합니다.
중급 단계

This class is geared towards biologists, bacteriologists, and bioinformaticians with a basic knowledge of comparative genomics.

완료하는 데 약 14시간 필요
영어

배울 내용

  • Learn how to assemble a bacterial genome

  • Learn how to annotate a bacterial genome

  • Learn how to generate a phylogenetic tree from a set of bacterial genomes

  • Learn how to perform basic comparative analyses of a set of bacterial genomes

공유 가능한 수료증
완료 시 수료증 획득
100% 온라인
지금 바로 시작해 나만의 일정에 따라 학습을 진행하세요.
유동적 마감일
일정에 따라 마감일을 재설정합니다.
중급 단계

This class is geared towards biologists, bacteriologists, and bioinformaticians with a basic knowledge of comparative genomics.

완료하는 데 약 14시간 필요
영어

제공자:

Placeholder

버지니아 대학교

강의 계획 - 이 강좌에서 배울 내용

1

1

완료하는 데 1시간 필요

Introduction

완료하는 데 1시간 필요
7개 동영상 (총 42분)
7개의 동영상
History of PATRIC and the BRC program3m
PATRIC overview - tabs and information16m
Registering and logging on to PATRIC2m
PATRIC workspace-Create Shared Workspace6m
Sharing a genome with other PATRIC users4m
Copying a genome annotation job to a shared workspace3m
1개 연습문제
PATRIC overview, login, and workspace sharing30m
2

2

완료하는 데 1시간 필요

Assembly

완료하는 데 1시간 필요
7개 동영상 (총 49분)
7개의 동영상
Uploading read files to the workspace for assembly11m
Submitting reads to the Genome Assembly Service8m
Selecting assembly strategies and submitting the assembly job8m
Monitoring the assembly job and reviewing job results7m
Genome coverage in Genome Report2m
Assembly questions and getting help with problems4m
1개 연습문제
Review of genome assembly30m
3

3

완료하는 데 2시간 필요

Annotation

완료하는 데 2시간 필요
7개 동영상 (총 77분)
7개의 동영상
Uploading contig files to the PATRIC workspace12m
Submitting a job to the PATRIC Genome Annotation Service7m
Reviewing the resulting Genome Report19m
Downloading the generated files 11m
Viewing your annotated genome in PATRIC15m
Finding help or reporting problems with the service5m
1개 연습문제
Review of genome annotation30m
4

4

완료하는 데 2시간 필요

Comprehensive Genome Analysis

완료하는 데 2시간 필요
10개 동영상 (총 101분)
10개의 동영상
Submitting a job using reads16m
Submitting contigs8m
Full Genome Report13m
Job Results11m
Assembly results11m
Annotation results12m
Viewing annotated genome12m
Finding help and citing5m
Hybrid Assembly Summary8m
1개 연습문제
Review of the Comprehensive Genome Analysis Service30m

자주 묻는 질문

궁금한 점이 더 있으신가요? 학습자 도움말 센터를 방문해 보세요.