3D SARS-CoV-19 Protein Visualization With Biopython

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학습자는 이 안내 프로젝트에서 다음을 수행하게 됩니다.

Biological sequence/ Data manipulation with Biopython

Query Biological Databases using Biopython & web-scraping

Create an interactive 3D model of SARS-CoV-19 Protein

Clock2 hours
Cloud다운로드 필요 없음
Video분할 화면 동영상
Comment Dots영어
Laptop데스크톱 전용

In this project you will create an interactive three-dimensional (3D) representation of SARS-CoV-19 (Coronavirus) protein structures & publication-quality pictures of the same, understand properties of SARS-CoV-19 genome, handle biological sequence data stored in FASTA & PDB (Protein Data Bank) and XML format, and get insights from this data using Biopython. This hands-on project will also give you a glimpse of tasks a Bioinformatician performs on a daily basis, along with the up-to-date concepts and database use cases in the field of Medical Research and Human genetics. In this project, we will also cover basics about important databases used by biologists and biotechnologists, along with the type of sequence data we can access and visualize from these databases using Biopython & Jupyter notebook.

개발할 기술

SARS-CoV-19BiopythonPython ProgrammingBioinformaticsBiotechnology

단계별 학습

작업 영역이 있는 분할 화면으로 재생되는 동영상에서 강사는 다음을 단계별로 안내합니다.

  1. Introduction to Biopython

  2. Understand FASTA file format

  3. Sequence manipulation using Biopython

  4. Transcription & Translation studies

  5. Perform Basic Local Alignment using NCBI-BLAST

  6. Reading PDB file

  7. Visualizing SARS-CoV-19 Protein structures

안내형 프로젝트 진행 방식

작업 영역은 브라우저에 바로 로드되는 클라우드 데스크톱으로, 다운로드할 필요가 없습니다.

분할 화면 동영상에서 강사가 프로젝트를 단계별로 안내해 줍니다.



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