We will learn computational methods -- algorithms and data structures -- for analyzing DNA sequencing data. We will learn a little about DNA, genomics, and how DNA sequencing is used. We will use Python to implement key algorithms and data structures and to analyze real genomes and DNA sequencing datasets.
제공자:
존스홉킨스대학교이 강좌에 대하여
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유연한 마감일
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공유 가능한 수료증
완료 시 수료증 획득
100% 온라인
지금 바로 시작해 나만의 일정에 따라 학습을 진행하세요.
완료하는 데 약 12시간 필요
영어
자막: 아랍어, 프랑스어, 포르투갈어 (유럽), 이탈리아어, 베트남어, 독일어, 러시아어, 영어, 스페인어
귀하가 습득할 기술
- Bioinformatics Algorithms
- Algorithms
- Python Programming
- Algorithms On Strings
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제공자:
존스홉킨스대학교
The mission of The Johns Hopkins University is to educate its students and cultivate their capacity for life-long learning, to foster independent and original research, and to bring the benefits of discovery to the world.
강의 계획표 - 이 강좌에서 배울 내용
완료하는 데 4시간 필요
DNA sequencing, strings and matching
This module we begin our exploration of algorithms for analyzing DNA sequencing data. We'll discuss DNA sequencing technology, its past and present, and how it works.
완료하는 데 4시간 필요
19개 동영상 (총 112분), 7 개의 읽기 자료, 2 개의 테스트
완료하는 데 3시간 필요
Preprocessing, indexing and approximate matching
In this module, we learn useful and flexible new algorithms for solving the exact and approximate matching problems. We'll start by learning Boyer-Moore, a fast and very widely used algorithm for exact matching
완료하는 데 3시간 필요
15개 동영상 (총 114분), 1 개의 읽기 자료, 2 개의 테스트
완료하는 데 3시간 필요
Edit distance, assembly, overlaps
This week we finish our discussion of read alignment by learning about algorithms that solve both the edit distance problem and related biosequence analysis problems, like global and local alignment.
완료하는 데 3시간 필요
13개 동영상 (총 92분), 1 개의 읽기 자료, 2 개의 테스트
완료하는 데 3시간 필요
Algorithms for assembly
In the last module we began our discussion of the assembly problem and we saw a couple basic principles behind it. In this module, we'll learn a few ways to solve the alignment problem.
완료하는 데 3시간 필요
13개 동영상 (총 83분), 1 개의 읽기 자료, 2 개의 테스트
검토
ALGORITHMS FOR DNA SEQUENCING의 최상위 리뷰
VK 제공2017년 8월 7일
This course provided me a very quick overview of all the core concepts pertaining to DNA sequencing. It is very well organized, crystal clear demonstration of concepts and I really enjoyed the course.
KP 제공2020년 5월 18일
Very good course this is. Just a little advice, please make the quiz questions more clear and more specific because one shouldn't waste time to understand a question which is very easy to implement.
NF 제공2021년 3월 9일
very engaging and well-presented course material. intermediate difficulty while conveying the basics of how even recent real-world genome alignment and assembly tools work. great course design!
MY 제공2020년 10월 9일
One of the most useful courses I have joined. Many thanks to the instructors for these quality lectures and for the time spent to deliver the information as easily as possible!
자주 묻는 질문
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